Einst standen zwei Kirchen in Niederzimmern. Eine davon, die St. Bonfacius Kirche, befand sich im Oberdorf nahe der “Oberen Schule”. Sie wird in einer Urkunde der Ersterwähnung des Ortes  “Zimmern infra“ im Jahr 876 benannt.
Bis zum Zusammenschluss beider Kirchen im Jahr 1852 war Johannes Cotta Pfarrer darin. Cotta war darüber hinaus auch als Chronist und Komponist tätig. Von ihm stammt unter anderem das Lied “ Was ist des Deutschen Vaterland ”. Seine Ehefrau war mit Johann Wolfgang Goethes Ehefrau, Christiane Vulpius, verwandt. Leider wurde die St. Bonifacius im 1854 abgerissen. Ihre Glocken brachte man in einem eigens dafür errichtetem Glockenhaus unter. Sie wurden bis zu ihrer Einschmelzung 1936 zu jedem kirchlichem Anlass geläutet. Ein Modell der St. Bonifacius steht heute in der St. Wigberti Kirche. Es wurde nach einer Darstellung auf einem Gemälde gebaut.

Die St. Wigberti Kirche
Um das Jahr 918 wird eine zweite Kirche erwähnt, die St. Wigberti Kirche im Unterdorf. Im Jahr 1372 begann man mit dem Bau der Kirche am heutigen Standort. Die Fertigstellung erfolgte erst im Jahr 1450 mit der Errichtung des Turmes, welcher als Wehrturm diente.
St. Wigberti gehört zu den eigenwilligsten Sakralbauten im Landkreis Weimar. Der in den rechteckigen Grundriss ohne Vor- und Rücksprünge nördlich einbezogene, mit Zinnenkranz und schlanker Spitzenhaube bekrönte Turm zergliedert das Innere derart, dass der außen am Sakristeianbau erkennbare Chor eine außermittige Lage erhalten musste. Eine weitgespannte hölzerne Tonnendecke überspannt das mit Doppelemporen ausgestattete Laienhaus.
In den Jahren 1617 / 1618 erfolgte der Umbau der Kirche. Eine lateinische Inschrift an der Nordseite belegt die Baumeister und ist heute noch erkennbar und ist unter diesem Text noch einmal übersetzt.

Während des Dreißigjährigen Krieges (1618-1648) durchritt am 30. Oktober 1632 der Schwedenkönig  Gustav Adolf den Ort Niederzimmern und hielt sich einige Zeit in der Kirche auf. Dieses Ereignis ist in 6 m Höhe in einer Steininschrift an der Nordseite des Turmes festgehalten. Im frühen 18. Jahrhundert wurde durch die radikale Umgestaltung des gotischen Baukörpers das heutige Erscheinungsbild der St. Wigberti Kirche geprägt.
Der aufgeständerte Kanzelaltar, mit schönen Schnitz- und Stuckarbeiten, wurde 1719 im Bauernbarock gefertigt. Der untere Teil und der Altar selbst gehörten ursprünglich nicht zusammen.
Links und rechts am Altar befinden sich je eine große Figur. Die linke stellt Moses mit den Steintafeln der “Zehn Gebote” dar, während die rechte Figur den Priester Aaron mit einem Weihrauchkessel zeigt. Zu den etwas älteren Ausstattungsstücken zählt der auf das Jahr 1655 datierte Opferstock aus Stein.In die Aussenmauern der Kirche sind alte kunstvoll gearbeitete Grabsteine aus dem 16. und 17. Jahrhundert eingearbeitet.
Im ummauerten Kirchhof stehen noch heute Grabmale aus der Zeit von etwa 1750 - 1830.Der bekannte Heimatdichter Oskar Wilhelm Imhof war von 1890- 1929 in Niederzimmern als Oberlehrer tätig. Er fand auf dem Schulhausboden eine wertvolle Statue der Heiligen Margarete. Er verkaufte das Original an Augustiner - Museum Eisenach. Eine Nachbildung der Statue befindet sich noch in der Kirche.
Der Erlös des Verkaufes kam 1932 der Kirchenrenovierung  zugute, die wahre Schätze zu Tage förderte. So wurde zum Beispiel unter dem grauem Anstrich der Doppelempore eine reiche Bemalung der Brüstungsfelder entdeckt.
Der Kunstmaler Heidelmann aus Weimar stellte fest, dass der wertvolle Fund mit der Darstellung der Bibelgeschichte bereits 1618 während Kirchenerweiterung gemalt wurde.
Nach dem die Gemälde vorsichtig und fachmännisch abgelaugt worden waren, restaurierte sie der Kunstmaler Ahnert und so erstrahlten die alten Bilder wieder in voller Schönheit.

Die Darstellung der gemalten Bibelgeschichten des Alten und Neuen Testaments an den Emporen lassen sich folgendermaßen erklären.
Da zu der Zeit als die Gemälde entstanden sind die meisten Bewohner des Ortes nicht Lesen und Schreiben konnten, wurde so anhand der Bilder die Bibelgeschichte erzählt. Diese Form der Darstellung wird als “ Biblia pauporum “ - Bibel für die Armen - bezeichnet.Im Jahre 1911 wurde bei Turmarbeiten die vergoldete Turmkuppel von 1746 gegen eine aus Kupfer ausgetauscht. Weiterhin wurde eine neue Wetterfahne angebracht.
Das Uhrwerk das dem 17. Jhrhundert wurde 1923 durch ein neues ersetzt.
Während eines schweren Gewitters 1972, schlug der Blitz in den Kirchturm ein und richtete durch einen Schwelbrand grossen Schaden an. Bei der anschliessenden Reparatur und Neueindeckung wurden abermals eine neue Wetterfahne und die restaurierte Turmkugel wieder aufgesetzt.
Durch eine Spende der Einwohner von Niederzimmern war es auch möglich eine Elektroanlage zum Läuten der Turmglocken einzubauen. Bis dahin musste jede einzelne der drei Glocken einzeln per Strang bewegt werden.
1988 bekam die Turmuhr ein neues Zifferblatt sowie neue Zeiger. Trotz grösster fachmännischer Anstrengung, gelang es aber nicht das 1923 eingebaute Uhrwerk wieder in Gang zu setzen.
Erst im Jahr 1994 konnte, Dank des Erlöses vom 3. Herbstfest 1993, eine neue Turmuhr eingebaut werden. Zum Kirchweihfest am 8. Juli 1901 wurde die neue Orgel mit einem Konzert vom Hoforganisten Gottschalk aus Weimar und vom Oberlehrer Imhof eingeweiht.
Die romantische Orgel wurde von der Firma Eifert aus Stadtilm gebaut. Sie verfügt über 26 Register und eine pneumatische Ton- und Registertraktur. Die Orgel besticht durch einen sehr üppigen Klang.
Da für das Orgelpositiv wenig Platz zur Verfügung stand, zog man die obere Empore etwas bauchig nach vorn. Dazu wurde ein Träger eingezogen und mit zwei Gusssäulen abgestützt.
1993 wurde die seit längerem defekte Orgel ausgebaut und restauriert.Ab 1991 wurde die Sanierung der ST. Wigberti Kirche dringend notwendig. So musste 1993 mit der Sanierung des Baufällig gewordenen Westgiebels begonnen werden.
Der Kirchturm wurde 1994 entrümpelt und das seit längerer Zeit stillgelegte Glockengeläut  instand gesetzt, so dass es zum Osterfest wieder geläutet werden konnte. Ab Mai 1994 wurde der mit Schwamm befallene Fussboden ausgeschachtet. Die Holzstützen der Doppelemporen und der Mittelstützpfeiler am Tonnengewölbe wurden mit Fundamenten gesichert.
Neuer Klinker - Fussboden wurde verlegt sowie die reparierten und neu gestrichenen Bänke wieder aufgestellt. Auch das Kirchenschiff bekam einen neuen Anstrich.
1996 wurde das Dach mit zwei Gauben an der Nordseite neu eingedeckt. Im Jahr darauf erfolgte die Sanierung der Kirchturmspitze. All die zahlreichen Arbeiten wurden auf Initiative und mit viel Engagement von Niederzimmerer Einwohnern ehrenamtlich ausgeführt.

Der mittelalterliche Wartturm
ist das Wahrzeichen von Niederzimmern. Man findet ihn ca. 0,5 km nordöstlich des Ortes auf dem “ Wartenberg “. Der Turm gehört zu einem ehemaligen Verteidigungsring von 16 Türmen rund um die Stadt Erfurt. Sie stehen, oder standen, meist einsam auf Anhöhen und sehen in der Landschaft recht verloren aus. Dabei spielten die Warttürme im Mittelalter eine zentrale Rolle im Schutz vor Angreifern. Sie standen alle in Sichtweite zueinander und waren mit Wächtern besetzt welche vermutlich auch direkt bei den Warten wohnten. Näherte sich nun ein Feind aus einer Richtung, so wurde auf dem jeweiligen Turm ein Feuer aus bereitgehaltenem Reisig entzündet. Dies zeigte den umliegenden Dörfern zum einem die Richtung aus der die Gefahr kam an und gab ihnen zum anderen noch genügend Zeit die Verteidigung zu organisieren und Hilfe herbei zu holen. So hatte die Stadt Erfurt zum Beispiel noch ca. eine Stunde Zeit sich auf einen drohenden Angriff vorzubereiten.


In den Kriegszeiten des 13. und 14. Jahrhunderts wurde das Erfurter Gebiet, damals 72 Dörfer,  mit Warttürmen zum Schutz gegen Angreifer abgegrenzt. Das Baumaterial und der Fugenverband des Wartturmes weisen auf ein Baujahr um 1400 hin. Unsere noch gut erhaltene Warte steht östlich auf dem Wartenberg und weist mit dem Eingang nach der Hopfgärtener Warte. Hopfgarten ist von Niederzimmern aus von keiner Seite sichtbar. Es war nur eine Verbindung durch Warten möglich. Die Eingangspforte ist viereckig und liegt 3.5 m über dem Boden. Die Turm höhe beträgt 7,40 m. Das untere Stockwerk ist mit Steinen gefüllt, das Obere ist durch Steinplatten vom Eingangsstock getrennt. Ein zweiter Turm stand auf dem Wartenhügel auf der Udestedter Höhe, dessen Mauerreste 1792 verkauft wurden.

Die Hopfgartener Warte 
blieb am besten erhalten. Sie hat eine Höhe von ca. 10 Metern. Die einzelnen Stockwerke sind durch Tonnengewölbe getrennt. Bis Anfang des letzten Jahrhunderts zeigte der Schlussstein des Eingangs das Erfurter Wappen ( Erfurter Rad ). In früheren Zeiten war noch eine stark beschädigte Jahreszahl sichtbar, deren erste beiden Ziffern die Zahl 13 darstellte. | Der Wartturm von Niederzimmern zeigt eine weit weniger sorgfältige Bauweise. Die Etagen sind durch Steinplatten getrennt. Auf älteren Abbildungen sind Zinnen sichtbar. vermutlich hatten alle Warten unserer Gegend Zinnen mit gemauertem Turmhelm zum Schutz gegen Witterungseinflüsse.
Niederzimmern gehörte erst ab 1345 zu Erfurt. | Die Warte muß also erst nach dieser Zeit entstanden sein, weil die vorhandenen Warttürme nur als | Signalstationen für das Erfurter Gebiet errichtet worden sind.
 
Der Barkhäuser Turm  
weicht in der Konstruktion von den bisher genannten Warten ab. Es ist möglich dass er durch Reparaturen und Umbauten sein heutiges Aussehen erhalten hat. Der Turm, von dem heute nur noch der obere Teil zu sehen ist, gehörte ursprünglich zum Klosterhof “ Barchhusen “, welcher von dem 1143 gegründeten Zisterzienser- Kloster Georgental abhängig war. Er steht auf einer Anhöhe zwischen Udestedt und Stotternheim.
Im Jahr 1189 wird “ Barchhusen “ zum ersten mal erwähnt.

Die Bienstädter Warte
Der erhaltene Rest des ehemaligen Wartturms steht an der westlichen Grenze des Erfurtischen Gebietes in Richtung Gotha.
Der vermutlich 1411 erbaute Turm wurde auch Uffhusener Warte genannt und diente dem Wartknecht sowie seiner Familie als
Wohnung.
Der Turm hatte ehemals eine Höhe von 18 m.

Das “ Frühwarnsystem “
der Warttürme wurde nicht erst im Mittelalter erfunden. Die Vorläufer der Warttürme sind in jenen alten Wachtürmen welche die Römer “ Spekula” nannten und die längs des grossen Römerwalles dem “ Limes” in kurzen Abständen standen, zu sehen | Die Reliefdarstellungen an der Trajansäule in Rom geben uns noch heute ein getreues Abbild jener alten Signaleinrichtungen.
Danach ging ein Wärter nachts mit einer Fackel um die obere Galerie des Turmes, wodurch ein sogenanntes Blicklicht entstand.
 Im inneren befand sich ein Herd, auf den nasses Heu oder Blätter gestreut wurden, wodurch eine Rauchsäule entstand. Mittels einer Zugklappe in der Decke wurden dann Warnsignale übermittelt.

Von dieser alten Einrichtung machte man im mittelalterlichen Deutschland mit seinen zahllosen Fehden wieder regen Gebrauch. Es entstanden nun solche Warten in zum Teil komplizierten Systemen wie in Frankfurt oder Heilbronn meist in Gegenden mit unübersichtlichem Gelände.
 
Die genaue Zeit der Erbauung ist meist nicht bekannt. Durch die vergleichende Zusammenstellung der   eigenwilligen Merkmale dieser Türme ist es jedoch gelungen , ein wohl einwandfreies Bild jener Wehranlagen zu gewinnen.

Die markantesten Eigenschaften der Warten sind:

1. Als Erbauungszeit gilt der Zeitraum von 1300 - 1500
2. Das unterste Stockwerk ist mit Schutt und Geröll aufgefüllt. 
3. Der Eingang liegt im zweiten Stock und ist nur über eine Leiter erreichbar.
4. Die Stockwerke sind durch Balkenlagen, Steinplatten oder Gewölbe getrennt.
5. Der Eingang wendet sich meist dem Punkt zu, mit welchem er in Beziehung steht.
6. Die Höhe des Turmes ist gleich seinem Umfang.